Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRSF5Q13243 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRSF5Q13243 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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