Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRJQ12913 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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