Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.19e-7■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 511.1□□□□□ -0.639e-7■■□□□ 11.7
GRSF1Q12849 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.43e-8■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-8■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-8■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.537e-11■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-11■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 HIPK1-206ENST00000369559 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.787e-11■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.017e-11■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.217e-11■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.357e-11■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 ITGB5-207ENST00000481591 1202 ntTSL 519.18■□□□□ 0.664e-9■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-9■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 517.2■□□□□ 0.344e-9■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 525.12■■□□□ 1.611e-6■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 11.6
GRSF1Q12849 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 226.47■■□□□ 1.836e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 325.29■■□□□ 1.646e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 412.35□□□□□ -0.436e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 412□□□□□ -0.496e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.496e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-208ENST00000414567 989 ntTSL 528.13■■■□□ 2.096e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-213ENST00000462924 1018 ntTSL 528.13■■■□□ 2.096e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-212ENST00000459777 834 ntTSL 327.9■■■□□ 2.066e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.016e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.876e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.576e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.46e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.386e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.366e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.346e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.216e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-214ENST00000466895 948 ntTSL 522.22■■□□□ 1.156e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 SLC39A5-203ENST00000419232 833 ntTSL 321.84■■□□□ 1.096e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.916e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 SLC39A5-208ENST00000447080 380 ntTSL 520.43■□□□□ 0.866e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-202ENST00000421263 460 ntTSL 220.2■□□□□ 0.825e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.661e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.656e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 218.41■□□□□ 0.545e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 317.53■□□□□ 0.45e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.386e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 EME2-206ENST00000570069 5613 ntTSL 217.25■□□□□ 0.356e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.166e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-203ENST00000428017 1103 ntTSL 215.62■□□□□ 0.095e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.035e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.075e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.125e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 URM1-205ENST00000470840 723 ntTSL 213.6□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 TFCP2-203ENST00000548108 1508 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.431e-10■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.576e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.645e-13■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.736e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.876e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.236e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.286e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.336e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.436e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.762e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.613e-8■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.353e-8■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.973e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-220ENST00000569342 1525 ntTSL 517.43■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-204ENST00000561951 845 ntTSL 312.55□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-202ENST00000561853 473 ntTSL 311.83□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-205ENST00000562012 865 ntTSL 510.39□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 BBS2-211ENST00000565781 6073 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.12e-6■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.967e-8■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.077e-8■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.77e-8■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.777e-8■■□□□ 11.5
GRSF1Q12849 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-10■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.023e-10■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.223e-10■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-10■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-10■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 224.09■■□□□ 1.453e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.153e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 218.29■□□□□ 0.523e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 ASPSCR1-207ENST00000579684 564 ntTSL 317.93■□□□□ 0.463e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-204ENST00000553368 304 ntTSL 316.19■□□□□ 0.183e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 213.91□□□□□ -0.183e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-208ENST00000554813 654 ntTSL 313.91□□□□□ -0.183e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.213e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.213e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-213ENST00000556296 571 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-207ENST00000554325 568 ntTSL 513.21□□□□□ -0.293e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-217ENST00000557181 566 ntTSL 313.21□□□□□ -0.293e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-216ENST00000557159 1803 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-8■■□□□ 11.4
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