RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245157.9

BBS2-201, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BBS2, Length 2,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-201ENST00000245157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.74■■■□□ 2.35
BBS2-201ENST00000245157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.27■■□□□ 1.8
BBS2-201ENST00000245157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
BBS2-201ENST00000245157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.62■■□□□ 1.69
BBS2-201ENST00000245157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
BBS2-201ENST00000245157 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.93■■□□□ 1.58
BBS2-201ENST00000245157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.79■■□□□ 1.56
BBS2-201ENST00000245157 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.78■■□□□ 1.56
BBS2-201ENST00000245157 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.65■■□□□ 1.54
BBS2-201ENST00000245157 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.51■■□□□ 1.51
BBS2-201ENST00000245157 HRCP23327 699 aa24.45■■□□□ 1.51
BBS2-201ENST00000245157 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
BBS2-201ENST00000245157 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.12■■□□□ 1.45
BBS2-201ENST00000245157 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
BBS2-201ENST00000245157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.04■■□□□ 1.44
BBS2-201ENST00000245157 TRIM41Q8WV44 630 aa23.91■■□□□ 1.42
BBS2-201ENST00000245157 SCRIBQ14160 1630 aa23.84■■□□□ 1.41
BBS2-201ENST00000245157 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
BBS2-201ENST00000245157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
BBS2-201ENST00000245157 ABCC9O60706 1549 aa23.66■■□□□ 1.38
BBS2-201ENST00000245157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.51■■□□□ 1.35
BBS2-201ENST00000245157 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.46■■□□□ 1.35
BBS2-201ENST00000245157 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
BBS2-201ENST00000245157 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.28■■□□□ 1.32
BBS2-201ENST00000245157 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
BBS2-201ENST00000245157 WIZO95785 1651 aa23.14■■□□□ 1.29
BBS2-201ENST00000245157 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
BBS2-201ENST00000245157 NACADO15069 1562 aa23.09■■□□□ 1.29
BBS2-201ENST00000245157 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
BBS2-201ENST00000245157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
BBS2-201ENST00000245157 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
BBS2-201ENST00000245157 ABCC8Q09428 1581 aa22.85■■□□□ 1.25
BBS2-201ENST00000245157 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS2-201ENST00000245157 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
BBS2-201ENST00000245157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
BBS2-201ENST00000245157 SOGA1O94964 1423 aa22.74■■□□□ 1.23
BBS2-201ENST00000245157 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
BBS2-201ENST00000245157 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.67■■□□□ 1.22
BBS2-201ENST00000245157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.63■■□□□ 1.21
BBS2-201ENST00000245157 CEP162Q5TB80 1403 aa22.63■■□□□ 1.21
BBS2-201ENST00000245157 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
BBS2-201ENST00000245157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
BBS2-201ENST00000245157 SMARCA4P51532 1647 aa22.55■■□□□ 1.2
BBS2-201ENST00000245157 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
BBS2-201ENST00000245157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
BBS2-201ENST00000245157 SMARCA2P51531 1590 aa22.53■■□□□ 1.2
BBS2-201ENST00000245157 NEUROD1Q13562 356 aa22.51■■□□□ 1.19
BBS2-201ENST00000245157 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.47■■□□□ 1.19
BBS2-201ENST00000245157 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
BBS2-201ENST00000245157 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
BBS2-201ENST00000245157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
BBS2-201ENST00000245157 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.34■■□□□ 1.17
BBS2-201ENST00000245157 APLP2Q06481 763 aa22.33■■□□□ 1.16
BBS2-201ENST00000245157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS2-201ENST00000245157 GOLGA3Q08378 1498 aa22.29■■□□□ 1.16
BBS2-201ENST00000245157 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
BBS2-201ENST00000245157 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
BBS2-201ENST00000245157 EEA1Q15075 1411 aa22.26■■□□□ 1.15
BBS2-201ENST00000245157 CLIP1P30622 1438 aa22.19■■□□□ 1.14
BBS2-201ENST00000245157 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
BBS2-201ENST00000245157 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.15■■□□□ 1.14
BBS2-201ENST00000245157 SYNJ1O43426 1573 aa22.13■■□□□ 1.13
BBS2-201ENST00000245157 MIER1Q8N108 512 aa22.11■■□□□ 1.13
BBS2-201ENST00000245157 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.11■■□□□ 1.13
BBS2-201ENST00000245157 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
BBS2-201ENST00000245157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
BBS2-201ENST00000245157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.07■■□□□ 1.12
BBS2-201ENST00000245157 ITGAEP38570 1179 aa22.01■■□□□ 1.11
BBS2-201ENST00000245157 VPS8Q8N3P4 1428 aa22■■□□□ 1.11
BBS2-201ENST00000245157 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
BBS2-201ENST00000245157 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.87■■□□□ 1.09
BBS2-201ENST00000245157 KIF21BO75037 1637 aa21.87■■□□□ 1.09
BBS2-201ENST00000245157 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
BBS2-201ENST00000245157 P3H3Q8IVL6 736 aa21.69■■□□□ 1.06
BBS2-201ENST00000245157 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
BBS2-201ENST00000245157 TOP2BQ02880 1626 aa21.69■■□□□ 1.06
BBS2-201ENST00000245157 ARAP1Q96P48 1450 aa21.67■■□□□ 1.06
BBS2-201ENST00000245157 PRXQ9BXM0 1461 aa21.65■■□□□ 1.06
BBS2-201ENST00000245157 KIF27Q86VH2 1401 aa21.64■■□□□ 1.05
BBS2-201ENST00000245157 CUX1P39880 1505 aa21.6■■□□□ 1.05
BBS2-201ENST00000245157 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
BBS2-201ENST00000245157 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.54■■□□□ 1.04
BBS2-201ENST00000245157 NCAPD3P42695 1498 aa21.5■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 KCNH8Q96L42 1107 aa21.5■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.49■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 CUX2O14529 1486 aa21.49■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.49■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.49■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.48■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.48■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
BBS2-201ENST00000245157 IGF1RP08069 1367 aa21.45■■□□□ 1.02
BBS2-201ENST00000245157 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.43■■□□□ 1.02
BBS2-201ENST00000245157 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
BBS2-201ENST00000245157 CFTRP13569 1480 aa21.42■■□□□ 1.02
BBS2-201ENST00000245157 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.4■■□□□ 1.02
BBS2-201ENST00000245157 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
BBS2-201ENST00000245157 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
BBS2-201ENST00000245157 HMGXB3Q12766 1538 aa21.33■■□□□ 1.01
BBS2-201ENST00000245157 BCANQ96GW7 911 aa21.32■■□□□ 1
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