Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-323■■■■■ 1762.1
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GRSF1Q12849 AL669831.3-209ENST00000440200 413 ntTSL 55.1□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 243.2
GRSF1Q12849 AL669831.3-203ENST00000419394 491 ntTSL 54.18□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 243.2
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GRSF1Q12849 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 149.9
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GRSF1Q12849 DGKI-209ENST00000483619 551 ntTSL 46.66□□□□□ -1.344e-20■■■■■ 128.9
GRSF1Q12849 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.724e-20■■■■■ 128.9
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GRSF1Q12849 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.782e-17■■■■■ 116.4
GRSF1Q12849 KIAA0825-201ENST00000329378 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 101.5
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GRSF1Q12849 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-19■■■■■ 98.5
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GRSF1Q12849 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-23■■■■■ 77.8
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GRSF1Q12849 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.437e-12■■■■■ 62.7
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GRSF1Q12849 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.341e-15■■■■■ 62.1
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GRSF1Q12849 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.683e-13■■■■■ 60.2
GRSF1Q12849 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-13■■■■■ 60.2
GRSF1Q12849 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.163e-13■■■■■ 60.2
GRSF1Q12849 BANF1-207ENST00000530204 586 ntTSL 59.58□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 57.4
GRSF1Q12849 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-16■■■■■ 56.5
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GRSF1Q12849 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-11■■■■■ 56.2
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GRSF1Q12849 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-203ENST00000524628 612 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-206ENST00000528648 362 ntTSL 39.83□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.48e-15■■■■■ 49.6
GRSF1Q12849 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.052e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.74■□□□□ 0.592e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.772e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.58□□□□□ -0.882e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.71□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 54.21□□□□□ -1.742e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.16□□□□□ -1.742e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.142e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 48.7
GRSF1Q12849 TMEM11-205ENST00000584432 1648 ntTSL 220.34■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 48.7
GRSF1Q12849 TMEM11-202ENST00000577419 1246 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 48.7
GRSF1Q12849 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC13.04□□□□□ -0.324e-8■■■■■ 48.3
GRSF1Q12849 GORASP2-211ENST00000497928 711 ntTSL 522.23■■□□□ 1.155e-9■■■■■ 44.8
GRSF1Q12849 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 518.67■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 44.8
GRSF1Q12849 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 418.45■□□□□ 0.545e-9■■■■■ 44.8
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