Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBA1Q02410 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA1Q02410 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 362.6 ms