Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCQ00610 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms