Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB1P53618 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB1P53618 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB1P53618 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB1P53618 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB1P53618 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB1P53618 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB1P53618 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB1P53618 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB1P53618 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB1P53618 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB1P53618 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB1P53618 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB1P53618 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB1P53618 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB1P53618 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB1P53618 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB1P53618 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB1P53618 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPB1P53618 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPB1P53618 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPB1P53618 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms