Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GBX2P52951 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBX2P52951 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GBX2P52951 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GBX2P52951 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBX2P52951 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBX2P52951 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBX2P52951 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBX2P52951 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBX2P52951 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX2P52951 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX2P52951 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX2P52951 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX2P52951 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBX2P52951 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBX2P52951 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBX2P52951 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBX2P52951 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX2P52951 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX2P52951 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX2P52951 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX2P52951 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX2P52951 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms