Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2A2P52657 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms