Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHKA1P46020 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA1P46020 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms