Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DCCP43146 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DCCP43146 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DCCP43146 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DCCP43146 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DCCP43146 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
DCCP43146 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DCCP43146 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DCCP43146 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DCCP43146 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DCCP43146 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DCCP43146 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
DCCP43146 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
DCCP43146 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DCCP43146 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DCCP43146 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DCCP43146 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DCCP43146 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
DCCP43146 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DCCP43146 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DCCP43146 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DCCP43146 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DCCP43146 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCCP43146 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DCCP43146 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DCCP43146 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DCCP43146 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DCCP43146 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DCCP43146 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DCCP43146 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms