Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNFP41002 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNFP41002 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNFP41002 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNFP41002 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNFP41002 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNFP41002 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNFP41002 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNFP41002 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNFP41002 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNFP41002 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNFP41002 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNFP41002 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNFP41002 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNFP41002 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNFP41002 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNFP41002 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNFP41002 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNFP41002 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNFP41002 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNFP41002 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNFP41002 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms