Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCAP28676 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCAP28676 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCAP28676 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCAP28676 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCAP28676 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCAP28676 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GCAP28676 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCAP28676 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCAP28676 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCAP28676 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCAP28676 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCAP28676 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCAP28676 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCAP28676 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCAP28676 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCAP28676 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCAP28676 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms