Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEA1P23193 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCEA1P23193 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TCEA1P23193 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEA1P23193 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCEA1P23193 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCEA1P23193 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms