Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB1P16220 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB1P16220 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB1P16220 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB1P16220 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB1P16220 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB1P16220 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB1P16220 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB1P16220 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB1P16220 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB1P16220 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB1P16220 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB1P16220 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB1P16220 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB1P16220 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB1P16220 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms