Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-EP13747 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-EP13747 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms