Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEFLP07196 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEFLP07196 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEFLP07196 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEFLP07196 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEFLP07196 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEFLP07196 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEFLP07196 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NEFLP07196 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NEFLP07196 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEFLP07196 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEFLP07196 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEFLP07196 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEFLP07196 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEFLP07196 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEFLP07196 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEFLP07196 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEFLP07196 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEFLP07196 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEFLP07196 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEFLP07196 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEFLP07196 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEFLP07196 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEFLP07196 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEFLP07196 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEFLP07196 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEFLP07196 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NEFLP07196 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEFLP07196 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEFLP07196 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEFLP07196 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEFLP07196 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEFLP07196 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NEFLP07196 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEFLP07196 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEFLP07196 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEFLP07196 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms