Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM3P06753 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM3P06753 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM3P06753 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM3P06753 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM3P06753 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM3P06753 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM3P06753 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM3P06753 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM3P06753 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM3P06753 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM3P06753 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM3P06753 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM3P06753 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM3P06753 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM3P06753 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM3P06753 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM3P06753 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM3P06753 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM3P06753 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM3P06753 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM3P06753 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM3P06753 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM3P06753 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms