Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM4AO75164 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM4AO75164 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms