Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA1GO43497 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1GO43497 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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