Protein–RNA interactions for Protein: A8MWV9

Putative uncharacterized protein LOC388820, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MWV9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MWV9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MWV9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MWV9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MWV9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MWV9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MWV9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MWV9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MWV9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MWV9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A8MWV9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A8MWV9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A8MWV9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A8MWV9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A8MWV9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A8MWV9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A8MWV9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms