Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB5A4FU69 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB5A4FU69 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
EFCAB5A4FU69 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB5A4FU69 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms