Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP15Q9Y4E8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP15Q9Y4E8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms