Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF6Q9Y252 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF6Q9Y252 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms