Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRNDQ9UKY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRNDQ9UKY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms