Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP4Q9UKK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP4Q9UKK3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP4Q9UKK3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms