Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMOD3Q9NYL9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD3Q9NYL9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD3Q9NYL9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD3Q9NYL9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
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