Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT1Q9NXH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms