Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRAK4Q9NWZ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRAK4Q9NWZ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRAK4Q9NWZ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms