Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARS2Q9NP81 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms