Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA1Q9NP55 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms