Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB1Q9H4B7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB1Q9H4B7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms