Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLK3Q9C098 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLK3Q9C098 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms