Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSG1Q9BU20 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSG1Q9BU20 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSG1Q9BU20 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms