Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH2D3AQ9BRG2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D3AQ9BRG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms