Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELENOSQ9BQE4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELENOSQ9BQE4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELENOSQ9BQE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SELENOSQ9BQE4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SELENOSQ9BQE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms