Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERGIC2Q96RQ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERGIC2Q96RQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERGIC2Q96RQ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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