Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPM1MQ96MI6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms