Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms