Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
COG3Q96JB2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
COG3Q96JB2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms