Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC34Q96HJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms