Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD8

SKA1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA1Q96BD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKA1Q96BD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA1Q96BD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA1Q96BD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms