Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3KBP1Q96B97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms