Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX31Q8N9S9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX31Q8N9S9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms