Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS6Q86YV9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms