Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HCC1LQ7Z5L2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms