Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms