Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CASC2Q6XLA1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms