Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF613Q6PF04 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms